本发明公开了一种城市初期雨水高效收集净化系统，包括附雨水口、净化系统、集水坑、第一雨水支管和第二雨水支管，所述附雨水口底部通过第一雨水支管与相对低位置的所述净化系统的入口连接，所述集水坑设置在所述净化池的出口端，且与所述粗粒径净化区通过穿孔花墙连通，所述集水坑底部出口通过第二雨水支管与所述主雨水口相对低位置连接；本发明还提供了一种基于上述收集净化系统的收集净化方法，使城市初期雨水冲刷地面后，沿纵坡和横坡在流入主雨水口之前先流入附雨水口，经净化系统净化后再汇入原有的城市雨水管网；该系统简单实用，不破坏现有设施，不影响市政设施功能使用以及美观，方便维护，且成本低，对初期雨水净化效果好。