本发明公开了一种三嵌段非离子型聚氨酯含氟短链表面活性剂及其制备方法。该三嵌段非离子含氟短链表面活性剂是聚乙二醇和二异氰酸酯按一定比例在有机铋催化下反应得到两端为异氰酸酯基团的预聚体，然后将该预聚体与短链氟醇偶联反应得到。本发明的特点是该三嵌段非离子含氟短链表面活性剂在水溶液中呈现优良的自组装性能和高的表面活性，同时制备方法简单，起始原料为通用试剂易于获取，合成过程无需有机溶剂，且较短的氟碳链和聚氨酯结构使其具有很好的生物相容性和生物降解性，可应用于药物运输、生物膜的模拟等，具有广阔的应用前景。