本发明提供一种高反光物体表面的结构光三维成像方法及系统，涉及三维测量领域。方法包括：向被测物体表面投影多组频率相同且光照强度不同的二值相移编码图案，根据反射的图像生成不同光照强度下的多个调制图片组，按光照强度降序排列；获取光照强度******的组中各像素点的光照饱和强度，得到饱和像素点，确定饱和区域，获取其他各组对应区域内与各饱和像素点一一对应的光照饱和强度最小且光照强度******的替换像素点并计算相位，用替换像素点的相位替代饱和像素点的相位，得到被测物体修复后的三维图像。本发明有效地解决了对高反光物体进行三维重建时由于反射率过高、光强度饱和而出现相位误差的问题，重建速度快、准确率高。