本发明涉及一种亲水性丙烯酰胺基交联聚合物微球的制备方法，包括以下步骤：1)将甲基丙烯酰氧乙基三甲基氯化铵加入蒸馏水中，再加入2,2‑偶氮(2‑甲基丙基脒)二盐酸盐搅拌均匀，再通氮气水浴加热反应；2)取出上述反应产物，先用乙醇清洗3遍，再加丙酮稀释，后放入烘箱中烘干粉碎；3)取硫酸铵加入到蒸馏水中，搅拌溶解，得到硫酸铵溶液；4)依次将丙烯酰胺、DMC、丙烯酸、2,2‑偶氮(2‑甲基丙基脒)二盐酸盐、共交联剂和分散剂加入3)的硫酸铵溶液中溶解；5)向上述溶液中通氮气水浴加热反应，得到亲水性丙烯酰胺基交联聚合物微球。本发明操作简单、过程环保，适用范围广，解决了现有技术不能得到同时具备亲水性与交联结构的微米级单分散聚合物微球的问题。