本发明公开了一种含有季铵盐杀菌基团的水性聚氨酯皮革涂饰剂的制备方法。首先通过多元醇与二异氰酸酯反应得到聚氨酯预聚物，然后加入制备的含有季铵盐杀菌基团的分子扩链剂，在催化剂的作用下反应1～4 h，再加入亲水扩链剂进行分子扩链反应，最后加入中和剂中和后再水中乳化得到杀菌季铵盐/聚氨酯水性涂饰材料，含有季铵盐杀菌基团的分子扩链剂具有优异的杀菌性能，且在结构上的双羟基可以与二异氰酸酯发生缩合反应，从而可在分子水平上被引入到聚氨酯基体中，不仅保持聚氨酯涂层有较高透明度和成膜性能，而且赋予聚氨酯涂料持久的杀菌性能。