本实用新型公开一种核磁管清洗装置，包括清洗容器，其顶部设置有凹槽，其内设置有清洗液流道，清洗液流道内镶嵌有内表面带刷毛的套管，套管内设置吸管，吸管低于清洗容器的上边缘，清洗容器底部设置有接头，吸管贯穿接头且与接头密闭连接，吸管外表面位于接头以上的部分设置有刷毛。该核磁管清洗装置结构简单，设计合理，可有效解决现有的核磁管清洗装置存在的清洗速度慢，清洗效果差的问题，同时有效减少了清洗液的使用量，避免对环境造成污染，降低了成本。