本发明属于组织工程生物支架材料及其制造技术领域，公开了一种藻酸盐/纳米黏土复合微载体及制备方法及装置，首先分别配制藻酸钠溶液与纳米黏土溶胶，两者均匀混合得到藻酸钠/纳米黏土纳米复合水凝胶。进一步在此水凝胶中混入干细胞悬液，另外还可加入生物活性因子或药物成分。然后，采用主要由高压电源和微量注射泵组成的静电液滴法微载体制备装置，使用盛有稀氯化钙溶液的敞口玻璃容器作为微载体的接收装置，设置适宜的注射速度和电压。本发明制得的藻酸盐/纳米黏土复合微载体和单纯藻酸盐微载体相比机械性能更强，且具有藻酸盐微载体所不具备的药物缓释能力，在干细胞治疗和组织工程领域具有极佳的应用前景。