本发明公开了一种耐受抑制物的木糖发酵菌株，其命名为SEB11，其保藏编号为CGMCC No.16570；本发明还涉及一种上述木糖发酵菌株的构建方法，其包括如下步骤：选取出发菌株SEB5；将所述出发菌株进行等离子诱变处理，挑选比出发菌株生长情况好或相似的菌落；将所挑选的菌株进行平板初筛和实际糖化液复筛，获得耐受抑制物的木糖发酵菌株SEB11；本发明还涉及上述木糖发酵菌株在利用木质纤维素中的木糖生产乙醇中的应用。本发明以可利用木糖的工业菌株为出发菌株，利用常压室温等离子体诱变技术进行诱变，根据在含抑制物的平板培养基中的生长情况及实际糖化液发酵复筛，获得具有优良抑制物耐受能力的木糖发酵突变菌株SEB11，其木糖消耗速率明显提升，表现出更好的发酵结果。