本发明提供了一种生物稳定性高的氟硅聚氨酯材料，属于生物医学材料领域。该发明的聚氨酯使用聚醚或聚碳酸酯二醇构成第一柔性链段、聚二甲基硅氧烷二醇作为第二柔性链段与二异氰酸酯和扩链剂构成的刚性链段共聚而成，其中扩链剂为小分子二醇或二胺与侧链含氟烷基的二元醇共混物。通过利用氟硅两种元素低表面能的特点，该聚氨酯在熔融加工或者溶液加工过程中，氟硅两种元素能够协同向表面迁移形成保护层，能够阻止水以及氧化性介质渗透到材料内部以提高材料的耐水解和抗氧化性能，在改善生物稳定性的同时，赋予该聚氨酯材料优异的表面性能和本体性能，可以应用于长期植入医用材料领域，如人工血管、人工心脏瓣膜、心脏起搏器导线、各种介入导管等。