本发明公开了一种含非圆曲轴带轮的发动机正时传动系统减振优化设计方法，正时传动系统包括正时皮带、曲轴带轮和若干个附件带轮，曲轴带轮通过正时皮带驱动各附件带轮转动，曲轴带轮为椭圆齿轮，方法包括以下步骤：步骤一、根据正时传动系统的初始结构建立其初始动力学模型；步骤二、定义设计变量和建立优化目标函数；步骤三、采用优化算法对正时传动系统进行优化，得到优化结果；步骤四、对优化结果进行验证。本发明能够减小正时传动系统的扭转振动，提升了正时皮带的使用寿命，并无需增加额外的减震装置，节约了减震装置的安装空间。