本发明公开了一种含磷本征阻燃热塑性尼龙弹性体及其制备方法，所述含磷本征阻燃热塑性尼龙弹性体是由羧基封端的尼龙预聚物、羟基封端聚醚多元醇和含磷二元醇类单体经熔融共聚反应得到如下结构通式[Ⅰ]表示的尼龙弹性体，或者由羧基封端的含磷尼龙预聚物和羟基封端聚醚多元醇经熔融共聚反应得到如下结构通式[Ⅱ]表示的尼龙弹性体。或该尼龙弹性体为多嵌段共聚物，其不仅含磷反应型阻燃剂经共聚嵌入了热塑性尼龙弹性体的分子链中，可实现低含量下的有效阻燃且持久性好，无迁移问题，还可对其中的软段、硬段和阻燃剂的比例进行调控，在高效阻燃的前提下满足不同应用领域的不同机械性能的需求。其制备方法也简单，原料易得，有利于扩大生产。