本发明提供了一种新的临床躯体症状分类诊断系统，它包括输入模块、输出模块和躯体症状诊断模块；其中输入模块用于用户填写临床躯体症状分类诊断量表，输出模块用于显示诊断结果；躯体症状诊断模块则负责通过临床躯体症状分类诊断量表，计算各维度的因子分、维度分和总分，并与阈值比较，得到最终诊断结果。本发明的躯体症状分类诊断量表以及其对应因子分、维度分和总分的阈值，是本发明系统的关键，能够保证本发明的准确性；进而，本发明的临床躯体症状分类诊断系统具备良好的应用前景。