本发明公开了一种合作伙伴选择与评价系统，其包括基础数据管理模块、合作伙伴管理模块、综合评价体系构建模块、选择评价模块、系统管理与维护模块和系统综合查询模块。本发明将若干指标分类为重要指标和次重要指标，采用灰色关联度法对重要指标进行限值计算与设定，将满足限值范围的重要指标使用模糊层次分析法进行评价，并将属于同一企业的指标的评价结果进行加权，得到与该企业对应的评价结果。本系统可将最终的评价结果生成表格进行输出，便于使用者直观查看、对比各个企业在各个方面的优势与不足，有利于提高合作伙伴选择与评价效率、提高企业自动化程度，降低人员成本。