本发明提供了一种鉴别微量体液斑的组织来源的方法，属于法医技术领域，采用FTA卡采集微量体液斑；将所述体液斑进行裂解并直接逆转录获得全长cDNA，对所述cDNA进行预扩增，得到预扩增产物；将预扩增产物进行纯化，将得到的纯化产物采用特异性位点的引物组合进行PCR扩增，根据扩增产物中的特异性位点的表达情况，判断体液斑的组织来源。本发明使用FTA卡采集微量体液斑后，将所有样本直接进行裂解及逆转录，******程度上减少cDNA的损失，再结合其它方法实现了对微量体液斑的组织来源的鉴别，对微量体液斑的灵敏度达到1pg。