本发明公开了一种基于GIS定位技术的洪灾风险预警及撤离系统和方法，包括：信息存储模块用于：向地理信息模块提供河道两岸地貌的航拍图片，向洪水动态监控模块提供预测的特定时间点的洪水流量，向洪灾区域划分模块提供预测的单次洪峰******流量。地理信息模块用于：向洪水动态监控模块提供河道剖面信息，向洪水区域划分模块提供河道两岸地理信息，这些信息都是由地理信息模块中的公共坐标地图上提供。洪水动态监控模块用于：向洪水区域划分模块提供淹没水位。洪水区域划分模块用于：向预警撤离模块提供洪水淹没区、洪水影响区范围信息。本发明优点在于：实现三维特征曲面信息以及三种洪水区域范围信息与公共坐标地图相结合、灵活方便主动发布预警信息和撤离方案的过程。