本发明公开了一种水光蓄多能互补发电系统的容量配置优化方法，包括发电容量配置优化和在发电容量配置优化的基础上进行的备用容量配置优化，其中：一、发电容量配置优化(即小时级优化)，采用如下公式实现优化：二、备用容量配置优化(即分钟级优化)，采用如下公式进行优化：三、根据F1、F2确定发电系统的容量配置优化策略。本发明有效解决了离网条件下水光蓄多能互补发电系统的容量配置问题，考虑了新能源本身的间歇性和随机性问题，以及系统发电容量和备用容量的耦合关系，显著提高了离网条件下水光蓄多能互补发电系统的供电可靠性。因此，本发明适于推广应用。