本发明公开了一种进行多株植物种类快速识别的算法，包括以下步骤：S1、获取含有多株植物叶片的图像；S2、对获取的图像进行二值化处理；S3、对二值化处理后的图像进行填充处理和边界提取处理，边界提取处理后获得各叶片所代表的连通区边界；S4、对获取的连通区进行连通区标记处理；S5、对标记后的连通区进行分割处理；S6、最后利用分割处理得到的图像进行植株种类的识别和叶片面积的计算。本发明中，将对图像的二值化、边界提取、连通区提取与分割和面积计算结合到一起，并结合单株植物识别软件，实现植物的多株识别，大大减少了调查所需的时间，提高识别效率，减少人力物力的消耗。