本发明公开了一种基于音频的圈养大熊猫自然交配结果的预测方法和系统，包括：采集圈养大熊猫自然交配时的叫声数据，得到原始音频数据；对采集到的原始音频数据进行预处理，得到预处理后的音频片段；对预处理后的音频片段提取梅尔倒谱系数特征；利用神经网络模型对提取的梅尔倒谱系数特征进行判断，分析预测音频片段中每一帧所预示的交配结果的预测概率；统计输入神经网络模型中的音频片段中的多个音频帧的预测概率，根据统计数据得到大熊猫交配结果的预测判断。该方法通过对大熊猫交配时的叫声进行分析，实现自动预测大熊猫自然交配的结果。辅助大熊猫繁育科研人员在大熊猫短暂的最佳交配期间实现最优的自然交配配对选择。