本发明公开了一种功能化脱细胞基质生物材料及其制备方法和应用，属于医用材料技术领域。本发明通过将脱细胞基质生物材料与甲基丙烯酸3‑磺酸丙酯杂化，同时实现了对脱细胞基质生物材料的交联及功能化。具体方法包括在脱细胞基质生物材料中修饰烯丙基、甲基烯丙基等碳碳双键结构，再将脱细胞基质生物材料浸泡在含有甲基丙烯酸3‑磺酸丙酯水溶液中，最后通过自由基聚合的方式对脱细胞基质生物材料进行交联及功能化。本发明通过聚合物网络实现对脱细胞基质生物材料的多位点、长程交联，同时引入了相应的功能性官能团从而实现对脱细胞基质生物材料的功能化。