本发明属于生物制药技术领域，具体涉及一种B群脑膜炎奈瑟氏菌重组菌毛蛋白Fim及其制备方法和应用。现有市场缺乏一种直接阻断脑膜炎奈瑟菌菌毛粘附进而预防脑膜炎的疫苗，本发明提供一种B群脑膜炎奈瑟氏菌重组菌毛蛋白Fim基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明首次发现其是脑膜炎奈瑟菌粘附定植的一个关键分子，将其克隆至蛋白表达载体后进行大规模表达，经过纯化后制备成重组蛋白，该重组蛋白纯度高，达到90％以上，重复性好，回收率较高。该蛋白可作为预防B群脑膜炎奈瑟氏菌感染的疫苗候选成分，具有可溶性表达、易纯化、纯度高、制备方法简便等优点，具有显著的经济效益。