本发明涉及生物医学领域，公开了一种长非编码RNA的癌症相关可变剪接数据库系统，以便于帮助研究人员更好理解癌症中lncRNA可变剪接的作用。本发明包括搜索模块、可视化模块以及文件交互模块：搜索模块用于根据用户输入的与长非编码RNA相关的搜索条件，从系统的数据区搜索出长非编码RNA在指定癌症中的剪接信息，并将搜索结果通过可视化模块展现给用户；当用户点击可视化模块展示中的搜索结果，可获得更详细的可视化信息和注释信息；其中,可视化信息包括剪接图、三文鱼图、箱式图和基因组浏览器；文件交互模块用于提供文件上传功能，以及搜索结果的下载和调用功能。本发明适用于癌症研究。