本发明公开了一种草地贪夜蛾多态性微卫星分子标记及其引物，所述的微卫星分子标记的核苷酸序列对应如SEQ ID ****～12所示，所述的微卫星分子标记引物对如SEQ ID ****3～36所示。本发明通过对草地贪夜蛾基因组中具有多态性的四碱基微卫星位点进行预测，对其中的33个位点进行多态性实验验证。首次筛选得到12个多态性较好的四碱基微卫星标记，包括中度多态性标记4个，高度多态性标记8个。为草地贪夜蛾入侵的遗传学研究提供分子技术支持，有助于对草地贪夜蛾这种高度多食性的物种进行分子生态学研究。