本发明公开了一种磁共振/荧光双模态纳米探针的制备方法，涉及医学检测技术领域，解决了现有技术中纳米探针单一的成像模式难以获得清晰的图像结果的问题。本发明的制备方法是以超顺磁纳米氧化铁SPIONs为核心，在SPIONs表面修饰近红外荧光分子Cy7、以及靶向多肽和/或其反式镜像结构作为配体构建能够靶向脑胶质母细胞瘤的磁共振/荧光双模态纳米探针。本发明的方法制得的双模态纳米探针可以整合磁共振和荧光成像的优点，提供更清晰的脑部肿瘤的解剖结构信息；成像过程中，引入本发明的方法制得的双模态纳米探针不仅可以提供更清晰的图像结果，还可以特异性的识别目标部位。本发明制得的双模态纳米探针还具有较好的体内稳定性。