本发明公开了一种聚酯弹性体/阳离子聚酯并列复合弹性纤维及其制备方法，属于纺织纤维技术领域。其包括以下步骤：对聚酯弹性体进行改性处理，得到改性聚酯弹性体；将改性聚酯弹性体与阳离子聚酯进行熔融并列复合纺丝，得到初始纤维；对初始纤维进行染色处理后，经洗涤后得到并列复合弹性纤维。本发明制得的聚酯弹性体/阳离子聚酯并列复合弹性纤维，具有良好的弹性、可以采用阳离子染料进行染色，染色皂洗牢度高，能够染深色，且色彩鲜艳的优点，可满足高档面料的高要求。