本发明提供了一种阳离子微泡‑rAAV‑miRNA病毒复合物及其制备方法以及应用，涉及生物学技术领域。包括如下步骤：制备阳离子微泡；合成带有负电荷的rAAV‑miRNA病毒；将所述阳离子微泡与所述rAAV‑miRNA病毒按照一定体积比混合，并在室温下孵育后形成所述阳离子微泡‑rAAV‑miRNA病毒复合物。本发明的复合物具有病毒的持续表达性和一定的靶向性，是一种miRNA干预的有效试剂。另外，本发明结合超声靶向微泡破坏(UTMD)技术介导阳离子微泡‑rAAV‑miRNA病毒复合物在心脏处靶向释放rAAV‑miRNA病毒以干预miRNA。在UTMD的作用下，使阳离子微泡‑rAAV‑miRNA病毒复合物爆破靶向释放rAAV‑miRNA病毒，能够进一步提高病毒的感染效率，从而增强miRNA的干预作用使miRNA的表达水平降低或上调。