本发明提供了一种基于网络药理学的中药作用机制模型的建立方法、系统及装置。该方法包括：获取中药各成分所对应的基因靶点，获取目标基因靶点，针对中药各成分所对应的基因靶点与目标基因靶点取交集得到基因集，对该基因集构建蛋白质相互作用网络，对蛋白质相互作用网络中的节点进行分析获取关键基因节点，对关键基因节点进行GO分析与KEGG分析进行进一步基因筛选，在筛选结果中，对中药成分与核心基因所对应的蛋白质进行分子对接，验证结合能力，得到目标中药成分。本发明的方案能够辅助进行高效的药物成分分析，简化分析过程，降低分析算法复杂度，方便快捷，准确率高。