本发明提供的大黄酸高产菌株腐皮镰刀菌R13(FusariumsolaniR13)，其保藏号是CCTCC NO:M 2013009，保藏单位是中国典型培养物保藏中心(CCTCC)，保藏日期是2011年1月9日。该菌株是从蓼科大黄属掌叶大黄活体中分离筛选得到的内生真菌，该菌株经液体发酵后能产生与其宿主掌叶大黄相同或相似的物质：大黄酸和大黄素，该类大黄酸、大黄素以游离态存在发酵上清液中。本发明还提供了发酵生产大黄酸的方法，通过液态发酵在25-28℃代谢产生大黄酸产率可达到5mg/L以上。