本发明属于法医学技术领域，具体涉及一种基于硅藻DNA焦磷酸测序图谱解析的法医学溺死地推断方法。本发明通过对溺死者肺组织中硅藻成分与可疑溺死地点水样中硅藻成分的DNA条码基因的焦磷酸测序图谱进行解析和比对，以推断溺死地点。本方法不依赖硅藻DNA条码基因的数据库信息，也不需要对硅藻群中每种硅藻成分进行种属识别和鉴定，而是直接对两硅藻群DNA提取物的DNA条码基因进行焦磷酸测序和图谱解析及比对，通过判断两图谱的一致性，以达到溺死地点识别的目的。本发明方法判断溺死地点准确且效率高。