本发明属于法医学技术领域，具体涉及基于56个Y染色体SNP遗传标记的法医学复合检测试剂盒。本发明解决的技术问题是利用Y染色体特定SNP遗传标记对中国男性个体检材进行C、G、H、J、N、R族群鉴定，并在Y染色体进化树上进行位置划分，从而进行族源推断。本发明的技术方案是基于56个Y染色体SNP遗传标记的法医学复合检测试剂盒，包括分离包装的复合扩增引物混合物和多重单碱基延伸反应引物混合物。本试剂盒应用复合扩增以及单碱基延伸技术，可一次性获得生物检材的56个Y染色体SNP遗传标记的基因分型，并将中国男性个体中的C、G、H、J、N、R族群样本正确归属至现已公认的Y染色体进化树细枝上。