本发明所述电催化氧化除杂设备包括恒电位仪、电催化氧化反应池、磁力搅拌器、缓冲槽、第一输送泵、第二输送泵和出液控制阀。本发明所述电催化氧化黄磷脱砷的方法，使用上述设备，步骤如下：①向电催化氧化反应池的阳极室和阴极室通入氮气排空空气，控制阳极室和阴极室内的温度为55～90℃；②向阳极室中加入电解液和被脱砷黄磷，向阴极室中加入电解液；③在氮气保护和搅拌下进行黄磷脱砷的电催化氧化反应；④反应完成后，将阳极室中水相和黄磷的混合液通入缓冲槽静置分相，控制缓冲槽内的温度高于黄磷的熔点，当水相和脱砷后的黄磷两相完全分离后，用高于黄磷熔点温度的超纯水清洗脱砷后的黄磷后得黄磷产品。