本发明涉及一种促进园区清洁能源消纳的多主体互动协调方法及系统，包括：计算园区配网的不平衡电量，若不平衡电量不为零，则利用清洁能源主体、储能主体和柔性负荷主体分别获取园区配网市场发出的互动协调信息；通过互动协调信息分别计算清洁能源主体、储能主体和柔性负荷主体的响应量和响应效益；按响应效益由高到低排序确定清洁能源主体、储能主体和柔性负荷主体的响应优先级；按照响应优先级和响应量确定互动方案，并计算剩余不平衡电量；若剩余不平衡电量不为零，则由电网对剩余不平衡电量进行平衡后将清洁能源主体、储能主体和柔性负荷主体按互动方案进行出力。本发明能够提高含清洁能源的园区配网中各主体的效益。