本发明提供了基于智能合约的传染病预警方法及传染病数据区块链系统。所述方法应用于传染病数据区块链平台，所述区块链平台包括：传染病预警智能合约、主节点以及多个共识节点，所述方法包括：所述主节点接收传染病类型的数据，确定所述数据的真实性，所述主节点启动所述传染病预警智能合约，并将所述数据发送至所述多个共识节点中的每一个共识节点，分别确定所述数据的真实性，并进行共识，将共识结果反馈至主节点并存储该传染病数据，主节点根据共识结果，判断共识结果所属传染病类型，若为特殊病种主节点直接发出传染病预警信号，若不是则判断传染病类型的累计值是否大于等于报警阈值，若大于等于报警阈值，则主节点发出传染病预警信号。