本发明公开基于潜在信息表征GAN的多模态MRI合成方法，包括步骤：将不同的MRI模态的集体信息输入生成网络；生成网络通过使用不同的编码器分别提取多种MRI模态的潜在信息表征；提取的潜在信息表征进一步传输到潜在空间处理网络进行集成处理；由解码器获得相应的合成目标模态，作为合成图像；将合成图像和真实图像共同输入至鉴别网络；由鉴别网络将真实图像与生成的图像区分开。本发明能够灵活的接收多个输入模态，并将多输入模态进行合成，能够有效避免信息丢失，有效提高合成图像的保真度，获得真实体现检测部位的高品质图像；适用范围宽，计算效率高，且实际运用效果好。