本发明公开了一种基于图像的动物物种细分类方法、系统及介质，包括：获取动物待分类图像；利用卷积神经网络定位所述图像中含有动物的目标区域，并进行动物物种粗分类得到动物所属物种；判断动物所属物种是否为已知物种；若否，则判定动物为新物种；若是，则将含有动物的目标区域的图像输入细分类网络模型中识别出动物的具体类别；判断动物的具体类别是否为已知类别；若是，则输出动物的类别；若否，则判定动物为新物种。该方法利用计算机对待分类图像进行自动识别和分析判断动物属于已知物种或新物种，提高数据采集和分析的效率，大大减轻人工工作量。并且不会动动物身体造成伤害，有利于辅助野生动物的调查和研究。