本申请提供了一种基于云储能系统的微电网多源协调优化的方法和装置，涉及能源领域。所述方法包括：根据单个微电网输出功率期望值，通过电价与用户侧负荷关系式，计算得到用户侧期望负荷值，通过成本最小公式和模糊遗传算法，计算得到储能装置的运行成本和单个微电网输出功率的实际值，控制单个微电网的实际输出功率，以使得单个微电网的输出功率满足平滑性指标且云储能系统的运行成本最小。本发明的方法，以抑制单个微电网的输出功率产生的波动为基础，在保障了云储能系统的运行成本最小的前提下，控制单个微电网的输出功率，最终实现在抑制微电网输出功率波动的同时，将云储能系统的成本做到最小化。