本发明涉及预测技术，解决了现有肿瘤新抗原分析无法采用一步法获得最后结果及根据临床结果的反馈提升预测的准确率的缺点，提供了一种临床个体化肿瘤新抗原的预测方法，其技术方案可概括为：将患者肿瘤细胞的测序数据与对应参考基因组进行比对得到DNA及RNA比对结果，进行预处理后分析肿瘤细胞中的体细胞变异、克隆类型、肿瘤纯度、肿瘤细胞中的基因表达量及体细胞变异等位基因表达丰度，得到分析结果，再分析潜在新抗原的亲和性及计算多肽递呈效力，根据分析结果、潜在新抗原的亲和性及多肽递呈效力对各对应的新抗原进行评分及排序后呈现。其有益效果是，标准化的过程可提高准确性，且具有更便捷的操作性及可重复性，适用于临床个体化肿瘤新抗原的预测。