本发明提供了一种基于基因及细胞信号通路的蛛网膜下腔出血预测模型建立方法及系统，该方法包括：获取正常脑细胞组1和SAH脑细胞基因芯片数据，并进行预处理；对正常脑细胞组1和SAH脑细胞基因芯片数据进行差异表达分析及信号通路分析；获取正常脑细胞组2和SAH脑细胞进行LCN2干预后不同条件下RNA‑Seq数据，并进行预处理，形成LCN2数据；对LCN2数据进行差异表达分析及信号通路分析；对经过差异表达分析获得的差异表达基因数据，进行特征选择，得到特征基因数据；基于特征基因数据获得训练样本，基于训练样本训练多个分类器，集成训练后分类器，建立预测模型。本发明可准确建立蛛网膜下腔出血模型并获得治疗靶点。