本发明公开了一种用甲醇脱除煤层气、页岩气等气体中氧的催化剂制备方法及应用。本发明的催化剂由活性组分、助催化剂等组成。所述催化剂活性组分为金属铜，所述助催化剂为镍、锰、铁、锌、铝中的一种氧化物或者几种氧化物。以氧化物计，本发明的催化剂前驱体中活性组分氧化物的质量含量为10-70%，助催化剂氧化物的质量含量为30-90%，使用甲醇作为煤层气、页岩气的脱氧原料。本发明开发的催化剂机械强度高，稳定性好，操作温度温和，处理气体量大，具有高效的除氧效率，适用于氧体积含量为0.1-5%的煤层气、页岩气等非常规天然气，能将原料气中的氧含量降到低于0.1%。